Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SALL4Q9UJQ4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms