Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CYTH4Q9UIA0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms