Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNA3Q9UI47 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CTNNA3Q9UI47 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms