Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UBQLN2Q9UHD9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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