Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRP68Q9UHB9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms