Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KDM5BQ9UGL1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDM5BQ9UGL1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms