Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EPHA6Q9UF33 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EPHA6Q9UF33 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms