Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLIP2Q9UDT6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLIP2Q9UDT6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms