Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms