Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
USP36Q9P275 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms