Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHRF1Q9P1Y6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHRF1Q9P1Y6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms