Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCHIP1Q9P0W5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms