Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PDP1Q9P0J1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PDP1Q9P0J1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms