Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDE1Q9NZC3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
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