Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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