Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ALKBH4Q9NXW9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms