Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHCHD3Q9NX63 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms