Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLN6Q9NWW5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms