Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
DEPPQ9NTK1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms