Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EMILIN3Q9NT22 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms