Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOMER3Q9NSC5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms