Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NRIP3Q9NQ35 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NRIP3Q9NQ35 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms