Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASCL3Q9NQ33 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms