Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms