Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZCCHC17Q9NP64 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms