Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC52A2Q9HAB3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC52A2Q9HAB3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms