Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC90BQ9GZT6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms