Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
POLR1EQ9GZS1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
POLR1EQ9GZS1 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms