Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms