Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BARHL1Q9BZE3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BARHL1Q9BZE3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms