Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC106Q9BWC9 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms