Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT17Q9BSW7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT17Q9BSW7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms