Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SEC22CQ9BRL7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms