Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
RETNLBQ9BQ08 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms