Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms