Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC85AQ96PX6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC85AQ96PX6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms