Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SAMD8Q96LT4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SAMD8Q96LT4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SAMD8Q96LT4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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