Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLMNQ96JQ2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms