Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LCORQ96JN0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LCORQ96JN0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms