Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG3Q96JB2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms