Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHDQ96IW2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHDQ96IW2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms