Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC34Q96HJ3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC34Q96HJ3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms