Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms