Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TSR2Q969E8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSR2Q969E8 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms