Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRG4Q92954 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms