Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms