Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNRF4Q8WWF5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms