Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
BHLHE22Q8NFJ8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms