Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CARMIL3Q8ND23 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARMIL3Q8ND23 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms