Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9F7

GDPD1, Lysophospholipase D GDPD1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1Q8N9F7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GDPD1Q8N9F7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms